Katedra Mikrobiologii z publikacją w prestiżowym czasopiśmie Nucleic Acids Research

Z przyjemnością informujemy, że artykuł pod tytułem „A transcription factor from the cryptic Escherichia coli Rac prophage controls both phage and host operons” (doi:10.1093/nar/gkaf113) został opublikowany w prestiżowym czasopiśmie naukowym Nucleic Acids Research. Czasopismo to cieszy się współczynnikiem wpływu (IF) wynoszącym 16,7!
Autorami pracy są badacze z Katedry Mikrobiologii UG: dr Ewa Wons, dr inż. Katarzyna Gucwa, mgr Natalia Lewandowska, dr Aleksandra Wiśniewska oraz prof. dr hab. Iwona Mruk - kierownik projektu. Współautorem pracy jest też dr hab. Łukasz Kozłowski z Uniwersytetu Warszawskiego, który specjalizuje się w modelowaniu struktur białkowych.
Niniejsza publikacja jest kontynuacją poprzednich artykułów opublikowanych w tym samym, renomowanym czasopiśmie naukowym NAR (2019, 2022 i 2024). W artykule pokazaliśmy, że niescharakteryzowany wcześniej fagowy czynnik transkrypcyjny, YdaT (analog represora CII faga Lambda) oprócz fagowych funkcji regulatorowych, wykazuje również silny efekt plejotropowy na fizjologię komórki E. coli, tzn. wpływa na ekspresję różnych operonów bakteryjnych, związanych z ruchliwością komórki, biosyntezą otoczki, produkcją kwasu kolanowego, tworzeniem biofilmu i podziałem komórkowym. Część tych efektów zachodzi poprzez wiązanie się YdaT do promotora  globalnego czynnika transkrypcyjnego RcsA. 
Nasze wyniki dostarczają nowych spostrzeżeń na temat sieci genetycznych gospodarzy profagów, które wydają się integrować operon z genem ydaT w złożony sposób, sprzyjając jego utrzymaniu w stanie wyciszonym. Jednak fakt, że potencjalnie toksyczny locus profagowy pozostaje niezmutowany, sugeruje jego znaczenie i potencjalne korzyści dla bakteryjnego gospodarza, które mogą pojawić się w warunkach suboptymalnych.

Praca zrealizowana była z funduszy projektu NCN (2019/35/B/NZ2/00701).